Tujuan pendidikan di ISMI adalah membentuk karakter peserta didik yang memiliki nilai-nilai akhlaqul karimah dengan penerapan adab-adab Islam sesuai yang Rasulullah shollallahu ‘alahi wa sallam ajarkan yang diterapkan dalam kehidupan sehari-hari agar menjadi anak-anak yang sholih bertaqwa kepada Allah.